QGIS au de la plateforme SINP de la Martinique MadiNati

Michaël DOUCHIN, 3liz

Observatoire Martiniquais de la Biodiversité

MadiNati - Les objectifs

Collecter, qualifier et stocker les données d'observations faunistiques et floristiques

• Une plateforme régionale du Système d'information de l'inventaire du patrimoine naturel (SINP) pour la Martinique
• Faciliter le regroupement, la validation et la diffusion des données géolocalisées sur la biodiversité
• Un réceptacle de données d'origine diverse : importation de jeux de données de différents acteurs

MadiNati

L'interface Web : une carte en pleine page avec un outil de recherche et d'affichage des observations

Partie visible de l'iceberg: c'est tout un système d'information et un ecosystème complet autour de QGIS et PostgreSQL

Les fonctionnalités principales

• Affichage des données de références sur la carte : Communes, mailles, masses d'eau, espaces protégés, fonds de carte
• Recherche d'observations multicritère :
  • par espèce, par date, par statuts (menace, protection, endémicité), par localisation spatiale, etc.
• Visualisation des observations sur la carte : maillées ou géométrie précise (ayants droits)
• Tableaux des données :
  • Statistiques : nombre d'observations par groupe d'espèces
  • Jeux de données et le nombre d'observations
  • Liste des espèces observés avec leur nombre d'observations
  • Liste des observations (ayant-droits)
• Fiche d'un taxon et fiche détaillée d'une observation (ayant-droits)
• Export aux formats tableur (CSV) et SIG (GeoJSON ou WFS)

Éléments d'interface

Éléments d'interface

MadiNati est basé sur des logiciels libres

Les principaux logiciels utilisés :

• QGIS, application SIG bureautique
• PostgreSQL, une base de données spatiale pour stocker, traiter et transformer les données d'observation
• QField, une application sur tablette (Android, iPhone) pour faire des relevés de données métier sur le terrain
• Lizmap Web Client, pour publier des cartes QGIS sur internet et créer des applications de saisie de données
• QGIS Server comme serveur cartographique pour Lizmap

QGIS - Importer les données de référence spatiale

L'ensemble des données de référence ont été visualisées dans QGIS puis importées dans la base de données PostgreSQL: communes, mailles, masses d'eau, espaces naturels

• Ouverture des jeux de données dans QGIS au format Shapefile
• Vérification du contenu et corrections éventuelles (nommages manquants, doublons, etc.)
• Menu Traitement: algorithme Exporter vers PostgreSQL qui permet d'envoyer les données locales vers la base de manière performante
• Mise en forme des données dans QGIS: symbologie, seuils d'échelle, étiquettes, etc.

Mise en forme des référentiels géographiques

Visualiser et retravailler les données

Les données d'observations sont collectées par différents acteurs : associations, collectivités, particuliers, etc.

Retravailler ces données dans QGIS pour qu'elle respectent le standard OccTax: liste de champs, nomenclature, règles

• Algorithme Refactoriser les champs du menu Traitement (ETL)
• Expressions QGIS pour trouver les données problématiques et les corriger to_date("date_observation", 'dd/MM/yyyy')
  Voir la présentation sur les expressions dans QGIS

Masques de saisies avec des formulaires

Pour éviter des corrections a posteriori et assurer des données confomes, des masques de saisie ont été conçus avec QGIS et publiés sur internet avec Lizmap Web Client

Masques - la puissance des formulaires QGIS

Utilisation des possibilités avancées des formulaires de QGIS

• Organisation des champs en onglet et groupes
• Listes déroulantes basées sur la nomenclature
• Relation entre les données
• Expressions pour contrôler les saisies
• Ajout de photographies et pièces jointes

Voir la présentation Formulaires QGIS avancés sur le web avec Lizmap

Exemples de masques de saisie dans QGIS

Exemples de masques de saisie dans Lizmap

Faire de la saisie sur le terrain avec QField

Les projets QGIS utilisés précédemment sont exploités dans QField pour permettre aux personnes de saisir les données sur le terrain avec ou sans connection internet

Le plugin QField permet dans QGIS :

• d'exporter les données du projet dans un GeoPackage
• de créer une version portable du projet pour travailler hors-connexion
• de synchroniser les projets et les données avec QFieldCloud

Nous avons généré des fonds de cartes spécifiques au format Mbtile avec l'algorithme Raster / Générer des tuiles XYZ (MBTiles) : IGN Plan, OpenStreetMap

QField - Configuration des couches

QField - les bonnes pratiques

Préparer grâce à QGIS des projets spécifiques pour le recueil de données terrain

• Un projet spécifique par acteur
• MAIS un modèle de données portable, modulaire et adaptable :
  • observateurs, espèces, nomenclature, observations
• Utiliser toutes les possibilités de QGIS: formulaires, thèmes de carte, nommage d'entité (expression), symbologie en fonction des données
• Simplifier : Limiter au maximum les données à saisir
• Attention à la volumétrie des données :
  • les couches essentielles
  • utiliser le MbTiles pour créer une seule couche de fond de carte avec les données de référence (communes, relief, cours d'eau, etc.)
  • éviter les couches "en ligne" selon le contexte (WFS, serveurs PostgreSQL)

QField - l'interface

• La carte en plein écran
• Des boutons pour zoomer et gérer le GPS
• Un menu "Hamburger" pour ouvrir le panneau de gauche
  • Liste des couches
  • Thèmes de cartes QGIS
  • accès aux paramètres
• Un appui long sur la carte pour identifier les données
  • sélectionner une ou plusieurs entités
  • modifier ou supprimer une entité

QField - l'interface

Le panneau ouvert avec :

• l'arbre des couches et le sélecteur de thèmes de cartes
• les 2 boutons en haut à droite pour basculer entre le mode Consultation et le mode Édition

QField - le formulaire de saisie

• le formulaire montre les onglets, groupes et les champs (listes déroulantes, cases à cocher, texte long, etc.)
• Le titre du haut apparaît en rouge si les expressions de contrôle des valeurs renvoient "Faux"
• il peut être affiché en plein écran
• support des relations

QField - les méthodes de synchronisation

• Utiliser le plugin QField depuis QGIS :
  • de retour du terrain
  • pas toujours évident à prendre en main
  • pour des données légères
  • pour une seule tablette
• Copier/coller les données à la main dans QGIS :
  • simple et robuste pour le géomaticien
  • ok si les données sont seulement ajoutées
  • ok si peu de personnes vont sur le terrain
• Utiliser l'application Web QFieldCloud :
  • simple d'utilisation : tout se fait depuis l'application de la tablette
  • on récupère les projets QGIS directement depuis la tablette
  • plusieurs utilisateurs peuvent ajouter/modifier/supprimer
  • payant pour du PostgreSQL (mais libre donc auto-hébergement possible)

Conclusion

• QGIS permet :
  • de visualiser, préparer et importer des données SIG de référence
  • d'analyser, corriger et mettre au format standard les données d'observation
  • de préparer des projets dédiés à la saisie avec des formulaires d'édition et des expressions
• Lizmap Web Client, basé sur QGIS Server, permet :
  • de proposer à des utilisateurs des cartes en ligne pour découvrir les données naturalistes: MadiNati
  • d'offrir aux acteurs des applications Web de saisie d'observations
  • consulter et saisir depuis le téléphone si connexion 3/4/5G
• QField permet de :
  • proposer aux non géomaticiens des cartes portables pour visualiser les données sur le terrain
  • saisir des données et les synchroniser avec la base centrale

Merci de votre attention !

Vos questions sont les bienvenues !